中东呼吸综合征是冠状病毒的一种。就基因来看，可以说是非典（SARS）病毒的“近亲”。病毒在自己的遗传信息传播时，有像人一样利用 DNA的种类(DNA病毒)，也有像中东呼吸综合征那样利用RNA的种类(RNA病毒)。RNA的分子结构比DNA更不稳定，如果遗传信息被错误复制，就很有可能会产生变种，这也是大家一直对中东呼吸综合征病毒担忧的原因。
首先，官民联合对策班专家认为其变种的可能性不大。大韩感染学会理事长金宇柱表示“如果中东呼吸综合征病毒发生变异并传染性变得更强，那么在第一名患者被感染的中东就会很猖獗，但事实并非如此”。他说明称，只是在免疫力下降患者较多的医院内部传染而已。实际上，中东呼吸综合征病毒在传染性方面与2003年非常流行的非典相比，非典四个月间在全世界扩散，出现8000多名患者，而相反中东呼吸综合征病毒并不如此。
与此相比，也有人表示“无法断定没有变种的可能性”。高丽大学药学院（病毒系）教授金正基（音）表示“基因突变可能会瞬间发生。潜伏期时可能会在宿主体内发生变异”。他表示“与非典不同，对Mers病毒特性的研究基本上尚未进行”，“传染性较弱的说法只是以有限的中东事例为依据的推测，并无科学证据”。“变种Mers”是否会出现要将中东的“始祖”病毒和韩国患者病毒的遗传体信息进行一一对照才能知道确切信息。韩政府已向国内外四家研究所委托进行该项分析，预计本周会出结果。
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